1958年湖北省農(nóng)業(yè)干部學(xué)校創(chuàng)建。

1958年湖北省水產(chǎn)學(xué)校創(chuàng)建。

1967年湖北省水產(chǎn)學(xué)校停辦。

1978年湖北省水利水產(chǎn)學(xué)校(水產(chǎn)部分)改建為湖北省水產(chǎn)學(xué)校。

2000年湖北省水產(chǎn)學(xué)校更名湖北省科技生物學(xué)校。

2002年湖北省科技生物學(xué)校、湖北省農(nóng)業(yè)干部學(xué)校、湖北省林業(yè)學(xué)校合并升格為湖北生物生態(tài)職業(yè)技術(shù)學(xué)院

2004年湖北生物生態(tài)職業(yè)技術(shù)學(xué)院(原湖北省科技生物學(xué)校與湖北省農(nóng)業(yè)干部學(xué)校部分)改建為湖北生物科技職業(yè)學(xué)院。

2004年湖北生物生態(tài)職業(yè)技術(shù)學(xué)院撤銷。

2004年湖北生物生態(tài)職業(yè)技術(shù)學(xué)院(原湖北省林業(yè)學(xué)校部分)改建為湖北生態(tài)工程職業(yè)技術(shù)學(xué)院。

2016年8月，入選第二批國家現(xiàn)代學(xué)徒制試點(diǎn)單位。