(1)申報進(jìn)料加工貨物發(fā)生實(shí)際進(jìn)出口時，進(jìn)出口申報應(yīng)向海關(guān)遞交下列單證：①進(jìn)出口貨物報關(guān)單（粉紅色）一式4份；②《登記手冊》；③貨物的運(yùn)單、發(fā)票、裝箱單；④海關(guān)認(rèn)為必要的其他單證。
　　(2)接受查驗(yàn)。
　　(3)辦理征免稅手續(xù)。
　　(4)海關(guān)對進(jìn)料加工進(jìn)出口貨物的監(jiān)管規(guī)定。對進(jìn)料加工進(jìn)出口貨物，海關(guān)區(qū)別情況，按以下規(guī)定進(jìn)行監(jiān)管：
　　①保稅工廠和備料保稅倉庫。如經(jīng)營單位所屬企業(yè)專門加工出口產(chǎn)品的工廠、車間或經(jīng)營單位本身擁有專門儲存進(jìn)口料件和加工成品的倉庫，建有健全的專用帳冊、專人管理制度，并具備海關(guān)嚴(yán)密監(jiān)管條件的，海關(guān)可以批準(zhǔn)其建立保稅工廠或備料加工保稅倉庫，其料件進(jìn)口進(jìn)先予保稅，加工后對實(shí)際出口部分所耗進(jìn)口料件予以免稅，不出口部分予以征稅。
　　②對口合同。對簽有料件進(jìn)口和加工成品出口的對口合同（包括不同客戶的聯(lián)號合同）的進(jìn)料加工，經(jīng)主管海關(guān)批準(zhǔn)，可對其進(jìn)口料件予以保稅，加工后對實(shí)際出口部分所耗進(jìn)口料件予認(rèn)免稅。
　　③按比例征稅。對不具備上述①、②項(xiàng)條件的進(jìn)料加工項(xiàng)下的進(jìn)口料件，海關(guān)根據(jù)《進(jìn)料加工進(jìn)口料件征免稅比例表》的規(guī)定，分別按85%或95%作為出口部分免稅，15%或5%作為不能出口部分照章征稅，如實(shí)際不能出口部分多于或少于已征比例，經(jīng)海關(guān)審核無訛后，分別予以補(bǔ)稅或退稅。
　　④全額征稅，出口退稅。對有違反海關(guān)規(guī)定行為的經(jīng)營單位和加工生產(chǎn)企業(yè)，海關(guān)認(rèn)為必要時，對其進(jìn)口料件，在進(jìn)口時先予征稅，待其加工復(fù)出口后按其實(shí)際所耗的進(jìn)口料件予以退稅。
　　⑤對國外客戶免費(fèi)提供或者有價提供有關(guān)進(jìn)料加工復(fù)出口商品所需進(jìn)口數(shù)量零星的輔料、包裝物料以及數(shù)量合理、直接用于服裝生產(chǎn)車間的打扣工具和膠針槍等小型易耗性生產(chǎn)工具，海關(guān)予以免稅。為簡化手續(xù)，海關(guān)憑簽章的合同副本，辦理上述物料的免稅登記手續(xù)，不再核發(fā)《登記手冊》。
　　⑥進(jìn)料加工項(xiàng)下進(jìn)口的料件，應(yīng)自進(jìn)口之日起1年內(nèi)加工成品返銷出口。如有特殊情況需要延長期限的，應(yīng)向主管海關(guān)申請延期。延期不得超過1年，逾期仍不能復(fù)運(yùn)出口，應(yīng)按一般貿(mào)易辦理進(jìn)口手續(xù)。
　　⑦已在海關(guān)登記備案的合同，如發(fā)生變更、轉(zhuǎn)讓、中止、延長、撤銷等情況，經(jīng)營單位應(yīng)于料件進(jìn)口前，據(jù)實(shí)向主管海關(guān)辦理變更或撤銷手續(xù)。
　　⑧出口合同中規(guī)定由國外客戶免費(fèi)或有價提供的原輔料和物料，加工成品后，如有剩余，由經(jīng)營單位提出申請，海關(guān)同意后，可以轉(zhuǎn)入其他出口合同繼續(xù)加工出口，如有內(nèi)銷，應(yīng)及時補(bǔ)交關(guān)稅和進(jìn)口環(huán)節(jié)稅。
　　⑨進(jìn)料加工項(xiàng)下的加工成品，原則上不宜以易貨方式出口，但如不能按計劃出口，需采取易貨方式銷往獨(dú)聯(lián)體、東歐國家的，應(yīng)由有關(guān)外貿(mào)公司向外經(jīng)貿(mào)主管部門報告，由外經(jīng)貿(mào)主管部門報外經(jīng)貿(mào)部有關(guān)司核準(zhǔn)，海關(guān)憑該司批件驗(yàn)放。
　　⑩進(jìn)料加工項(xiàng)下的加工成品，對外成交結(jié)匯后應(yīng)實(shí)際離境出口，不允許外商委托我境內(nèi)加工企業(yè)或外貿(mào)經(jīng)營單位將成品直接從我境內(nèi)運(yùn)往獨(dú)聯(lián)體、東歐國家。
　　⑾進(jìn)料加工合同項(xiàng)下免稅進(jìn)口的料件，應(yīng)堅持專料專用，不得與國內(nèi)其他料件串換使用。在特殊情況下，因加工出口成品急需，擬使用國內(nèi)同品種、同規(guī)格、同等數(shù)量的原材料頂替進(jìn)口原材料，并無出售盈利賺取差價等問題，應(yīng)事先報主管海關(guān)核準(zhǔn)。
　　⑿海關(guān)對有色金屬、黑色金屬、棉花紡紗行業(yè)的進(jìn)料加工，因生產(chǎn)工藝必須與國內(nèi)其他料件串換使用，有以下規(guī)定：
　　一是工藝性料件串換，經(jīng)營單位應(yīng)經(jīng)主管海關(guān)核準(zhǔn)，并具備保稅工廠監(jiān)管條件；
　　二是工廠要健全管理制度，按海關(guān)要求建立帳冊、記錄投料與產(chǎn)出時間備查。不允許先出口后進(jìn)口，或不經(jīng)加工在國內(nèi)收購產(chǎn)品出口。不允許倒賣進(jìn)口料件。
　　三是出口成品中，屬于搭配使用國產(chǎn)原料加工出口部分，如屬應(yīng)征出口稅的，可予免稅。
　　四是對進(jìn)料加工出口產(chǎn)品，出口企業(yè)向海關(guān)申請進(jìn)料免稅之前，須持外經(jīng)貿(mào)主管部門的批件，送主管出口退稅稅務(wù)機(jī)關(guān)審核蓋章，并將批件復(fù)印留存?zhèn)洳椤．a(chǎn)品出口時，企業(yè)應(yīng)增填一份“出口退稅貨物專用報關(guān)單”。對出口企業(yè)報關(guān)出口但不實(shí)際離境的產(chǎn)品，不予辦理退稅。
　　五是凡經(jīng)營金銀制品的進(jìn)料加工企業(yè)，所需金銀進(jìn)口時，應(yīng)向海關(guān)提供中國人民銀行總行，或其授權(quán)的分行的批件，否則，海關(guān)不予放行。
　　六是根據(jù)外經(jīng)貿(mào)部規(guī)定，下列商品開展進(jìn)料加工需經(jīng)外經(jīng)貿(mào)部審批，海關(guān)憑外經(jīng)貿(mào)部批件及其他有關(guān)文件辦理登記備案手續(xù)；
　　a.禁止出口商品;
　　b.軍民通用化學(xué)品;
　　c.易制毒化學(xué)品;
　　d.重水;
　　e.食糖的進(jìn)料加工需報外經(jīng)貿(mào)部審批，但不包括以進(jìn)口白糖為部分原料加工食品、糧食制品復(fù)出口的業(yè)務(wù)。對以進(jìn)口白糖（包括砂糖、棉白糖等）為部分原料加工食品、糧食制品復(fù)出口的業(yè)務(wù)，批量進(jìn)口在500噸以上，或年進(jìn)口量超過1000噸的，由有關(guān)外貿(mào)總公司、工貿(mào)公司或地方外經(jīng)貿(mào)委報外經(jīng)貿(mào)部審批。限額以內(nèi)的仍按原管理辦法辦理有關(guān)手續(xù)。經(jīng)營單位應(yīng)簽訂進(jìn)出口對口合同，原料進(jìn)境后加工復(fù)出口期限不得超過半年。
　　f.開展銅及銅基合金、食糖、新聞紙、原油（成品油）、鋼鐵、生鐵、鋅錠、鋁及鋁基合金的進(jìn)料加工業(yè)務(wù)憑外經(jīng)貿(mào)部的批件進(jìn)行審批管理。