1、通關作業流程
　　特點：受理申報、統計復核、審單、征稅、查驗、放行等各項作業分別在基層海關——直屬海關——基層海關進行；審單作業系統、物流監控系統和職能管理系統三大作業系統將貨管、征稅、統計等部門融合運作，共同參與管理。
　　2、現場海關作業流程
　　現場海關作業流程即在基層海關進行的現場接單審核、稅費處理、查驗、放行、簽發報關單證明聯等一系列的作業。在此流程，企業和報關員在通過現場大屏幕或BP機發送的信息得知本單位電子申報通過審單中心審核后，向現場海關遞交有關報關單證，協助海關查驗，繳納稅費、提取貨物、領取報關單證明聯等。