日本交通運輸業發達，已形成以海運為主，海、陸、空密切結合的現代化交通運輸體系。國際航運中，貨運以海運為主；客運以航空為主。國內客運以鐵路和公路為主；貨運以公路和海運為主。日本擁有龐大的海洋船隊，與世界各地都有航線相通。著名的海港有東京、橫濱、名古屋、大阪、神戶等。

首都的羽田機場和成田機場是日本的空中大動脈，在2008年世界機場服務質量的排名中，東京羽田機場位列第一，函館、福岡、大阪、關西、北九州、那霸的機場都是日本的空中交通樞紐。日本航空、全日空、北海道國際航空、天馬航空（SKY）是日本四大航空公司，是日本空中交通的重要標志。

日本的陸路交通大部分依賴地鐵、輕軌、鐵路等軌道交通，日本鐵路的客運服務始于1872年，包括JR和私鐵在內的鐵道的總運行距離為27929公里，新干線是日本的高速鐵路客運專線系統，以u201c子彈列車u201d聞名。2015年，運送旅客人數達到240億人次。^[34]