福州工商學院始建于2002年，前身為福建農林大學東方學院，是教育部批準并獲得首批確認的一所本科層次的高等院校，福建農林大學對東方學院的教學和教學管理負責，對學院的規劃籌建、專業設置、教學組織、學科建設、師資配備、學生管理、招生和就業、安全保衛等工作進行指導、幫助和考核。2019年6月，經教育部批準，福建農林大學東方學院轉設為福州工商學院。

福州工商學院新校區位于福建省福州永泰葛嶺鎮，校園占地面積近800畝，校園風景秀麗、四季梅李花香。整個校園分為教學行政區、學生生活區、圖書館與體育運動區、對外交流與教學實訓區、景觀內湖等五大部分。新校區辦學設施齊全，萬兆光纖網絡覆蓋全校，智慧校園建設初具規模；建成了省內高校領先水平的云桌面系統和云數據共享平臺，初步實現云財會實驗模擬仿真，建成了20多個專業教學實驗室和校內經管實訓基地，為學生創造了一流的學習和生活條件，是莘莘學子求學的理想園地。

福州工商學院綜合實力歷年排名均名列福建省前茅，學校與福建農林大學在師資、教學管理經驗及其他綜合辦學平臺上實施平等共享，發揚u201c求真務實、開拓創新u201d的優良學風與校風，結合學校自身辦學機制靈活的優勢，以學生為本，因校管理，因材施教，以培養為中國經濟建設和社會發展所需的高級應用型和研究型專業人才為己任。致力于建設一所有一流辦學水平，具有一流辦學設施和鮮明辦學特色的高等院校。

2019年，更名為福州工商學院。