1450年11月3日，阿拉貢王國國王，u201c寬宏者u201d阿方索五世（Alfonso V de Aragón，el Magnánimo，因同性戀寬容政策獲得寬宏者的榮譽）下令成立巴塞羅那大學。

巴塞羅那大學的源頭誕生于西西里的馬蒂諾二世（Martín I el Humano）（1356-1410）時期，他曾設想在巴塞羅那頒發醫學學位。然而巴塞羅那的自治委員會（Consell de Cent）拒絕承認其資質；此外萊里達的教育總會（Estudio general de Lérida）也提出抗議，因為這會破壞阿拉貢聯合王國的高等教育壟斷地位。

1450年，在早前的文藝復興領袖，教皇尼古拉五世（Pope Nicholas V）訓諭和寬宏者阿方索五世國王的統治下，巴塞羅那研究總院，也就是當時的大學正式成立。包括了當時一些已有的教學機構，如教會學校和市屬學校。因此，大學具有和其他大學不一樣的市屬特征，受到更少的國王控制。大學的教學點位于市區不同的場所：大教堂，圣弗朗西斯科修道院（圣方濟宗的）和圣卡塔麗娜修道院（多米尼加宗的）。第一棟建筑于1536年建成于蘭布拉大道（la Rambla）的上區，連接著城墻（位于Canaletes，今天的加泰羅尼亞廣場-Plaza de Catalu?a和圣安娜之門-Portal de Santa Ana）。

十八世紀，也就是三百年后的1715年，第一位來自法國波旁王朝的西班牙新國王腓力五世（也是今天西班牙王室的祖先）下令大學總部和其他的加泰羅尼亞大學一起轉移到塞韋拉（萊里達）以感謝其居民在西班牙王位繼承戰爭中對法國安茹公爵的支持。這種情況持續了150年，直到19世紀大學再次回到巴塞羅那。那里培養了如Jaime Balmes，José Finestres等人。

1837年開始新的遷校行動：在塞韋拉的大學被取消，學校遷回巴塞羅那。遷校歷時五年，于1842年結束，UB成為當時加泰羅尼亞唯一的大學。1838-1839學年學校開始授課，授課地點先是在加爾默羅會的舊修道院（位于卡門街，Doctor Dou大街的上區）。但該地在1835年的騷亂之后建筑狀況不佳，于是人們決定建設新的總部。Elías Rogent接到了建設的任務，工程于1863年開工，1882年施工完成。新的總部位于巴塞羅那新建的Eixample區，非常靠近老城區，也就是被稱為歷史建筑區的地方。該大學廣場建筑群作為人文科學校區，是校長辦公室所在地（周圍是巴塞羅那著名的同性戀聚集區）。在這一建筑里教授除醫學以外的所有其他課程，而醫學課程則在圣克魯茲醫院（el Hospital de la Santa Cruz）教授，1905年以后改在臨床醫院（el Hospital Clínico）教授。

90多年后的1932年，西班牙第二共和國政府給了大學自治權，并更名為巴塞羅那自治大學（不同于今天的巴塞羅那自治大學）。但隨著弗朗哥獨裁統治的到來，自治在1939年被廢除，學校進入了一個衰退期：大量教師被流放而被新政府的教師取代，造成人才危機。此后UB一直是加泰羅尼亞和巴利阿里群島唯一的大學，這種情況一直持續到1968年，其他大學開始建立（這一新建大學過程持續到90年代）。與此同時，UB也開始了自身的擴張，在巴塞羅那新建不同的學院：如Pedralbes，Sants，Bellvitge和Mundet。2005年，依照大學任命法（la Ley de Ordenación Universitaria），選舉產生了第一位普選產生的校長Màrius Rubiralta Alca?iz。2006年10月，地理-歷史-哲學系的新大樓在Raval區落成。同樣的，最近幾年大學也對其他建筑進行了改造。

學校正在配合歐盟的地平線2020科研計劃不斷發展中。將在Diagonal校區修建一個市民廣場，建設跨學科的建筑，新的餐廳，禮堂，擴大巴塞羅那科技園，遷移位于歷史建筑區的數學系。此外，還計劃在Santa Coloma de Gramanet，Bellvitge和Badalona建立住宿，教學，科研中心。